Växtsamhällets sammansättning och utseende påverkas bland annat av landhöjningen. Olika vegetationsbälten avlöser varandra i riktning från havsstranden och återspeglar den gradvisa omvandlingen av havsbotten till land. Det land som vinns blir med tiden skogsbevuxet.

Den utefter hela Bottenvikskusten vanligt förekommande floran finns även här. Exempelvis gultåtel, strandråg, olika starrarter, höstfibbla, åkermolke m.fl.

Skeppsvik har också flera typer av växter som inte återfinns på många andra platser i Sverige. dessa har följt med den ballast som segelskutorna förde med sig till Skeppsvik, från olika platser i Europa.